甲状腺癌的并发症主要发生在治疗期间或术后，部分由肿瘤本身侵犯引发，及时干预可有效减轻危害、改善预后。术后并发症最为常见，其中喉返神经损伤会导致声音嘶哑、饮水呛咳，严重时可能出现呼吸困难，多由手术操作牵拉或损伤神经所致，多数可逐渐恢复。
甲状旁腺功能减退也是术后常见并发症，因手术损伤甲状旁腺，导致钙吸收异常，出现手脚麻木、抽搐等症状，需长期补充钙剂。此外，术后可能出现切口出血、感染，表现为切口红肿、疼痛、渗液，需做好切口护理预防。
肿瘤侵犯引发的并发症，包括侵犯气管导致呼吸困难、咯血，侵犯食管引起吞咽困难，转移至颈部淋巴结会出现颈部肿块。晚期远处转移还可能损害肺、骨等器官，出现咳嗽、骨痛等症状。规范治疗、做好术后护理，能显著降低并发症发生率，减轻患者痛苦。
